Liiton virallinen johto on käytännön toimintaa koordinoiva liittohallitus ja hallitusta ohjaava ja valvova liittovaltuusto. Sääntöjen mukaan valitaan lisäksi tilintarkastaja. Nämä valitaan joka kolmas vuosi liittokokouksessa, viimeksi 26.–27.9.2020.
Käytännössä on lisäksi erilaisia nimettyjä toimihenkilöitä kuten Vapaa Ajattelija -lehden tekijätiimi sekä eräiden www-sivujen ylläpitäjät.
Liittohallitus
Hallitukseen kuuluu puheenjohtaja, kahdeksan varsinaista jäsentä sekä neljä varajäsentä sijalleastumisjärjestyksessä. Hallitus valitsee keskuudestaan varapuheenjohtajan ja pääsihteerin.
Hallituksen jäsenet tavoittaa sähköpostilla mallia etunimi.sukunimi@vapaa-ajattelijat.fi.
Puheenjohtaja Jape Lovén (Helsingin seudun VA)
Varsinaiset jäsenet
- Ritva Ahonen (Turun VA)
- Timo Karjalainen, pääsihteeri (Oulun seudun VA)
- Yki Räikkälä (Satakunnan VA)
- Riku Bähr (Tampereen VA)
- Marjatta Syväterä (Tampereen VA)
- Liisa Taskinen (Kotkan VA)
- Antti Värri, varapuheenjohtaja (Tampereen VA)
- Esa Ylikoski (Helsingin seudun VA)
Varajäsenet
- Harry Anttila (Helsingin seudun VA)
- Eero Suorsa (Turun VA)
- Timo Mykrä (Etelä-Karjalan VA)
- Olli Palokangas (Oulunseudun VA)
Liittovaltuusto
Valtuustoon kuuluu puheenjohtaja, kymmenen varsinaista jäsentä sekä viisi varajäsentä sijalleastumisjärjestyksessä. Valtuusto valitsee keskuudestaan varapuheenjohtajan ensimmäisessä kokouksessaan.
Valtuuston jäsenet tavoittaa sähköpostilla mallia etunimi.sukunimi@vapaa-ajattelijat.fi.
Puheenjohtaja Kari Pasanen (Keski-Suomen VA)
Varsinaiset jäsenet
- Robert Brotherus, varapuheenjohtaja (Helsingin seudun VA)
- Jani Hinkka (Tampereen VA)
- Arttu Häyrynen (Keski-Suomen VA)
- Kerttu Loukola (Helsingin seudun VA)
- Pertti Periniva (Kemin VA)
- Tauno Perkiö (Satakunnan VA)
- Tapio Pilli (Lahden VA)
- Reijo Raappana (Luoteis-Lapin VA)
- Aki Räisänen (Kainuun VA)
Varajäsenet
- Mikko Hangelmaa (Turun VA)
- Thomas Mangs (Helsingin seudun VA)
- Raimo Rintamäki (Forssan VA)
- Tanja Laine (Satakunnan VA)
- Martti Vaattovaara (Luoteis-Lapin VA)
Muut nimetyt henkilöt
- Vapaa Ajattelija -lehti:
- vastaava toimittaja: Esa Ylikoski
- toimitussihteeri: Risto K. Järvinen
- muu toimituskunta: Jori Mäntysalo, Yki Räikkälä
- Pääsivun vapaa-ajattelijat.fi webmaster: Marko Koivuniemi
- uskonnonvapaus.fi-sivun webmaster: Jori Mäntysalo
Tilintarkastus
Liiton tilintarkastajana toimii Timo Vilén, varalla Simo Dückstein. Molemmat ovat HT-tilintarkastajia.